中心建设的经费落实情况:
2005-2008年总投入经费投资总额912.8917万元，其中学校经费778.1817万元，日元贷款经费134.71万元（执行中），中心正式获准立项建设后投入经费54.7810万元。自2008年5月开始启动的第二批日元贷款设备150万元未计入总额。
中心建设经费由中心项目组根据建设项目提出使用计划，经领导小组审定，由主管校领导批准，报请校党委会核准后使用。
设备采购验收时对经费使用情况进行审查，大额款项和重要设备采用招标方主要经费使用情况如下：
1．仪器设备采购经费629.6226万元
2．一般设备采购经费36.1255万元
3．实验设备安装、装饰配套121.5436万元
4. 教材建设支出2.0万元
5. 教学改革研究8.6万元
6. 人员培训13.0万元
7. 其它支出（办公）2.0万元
经费实际支出情况:
中心建设经费由中心行政办公会根据建设项目提出使用计划，经领导小组审定，由主管校领导批准，报请校党委会核准后使用。
设备采购和实验室装修等方面，在验收时对经费使用情况进行审查，大额款项和重要设备采用招标方式。
教材建设、教改立项、人员培训、对外交流等方面的经费由中心根据实际需要提出申请，分别由教务处、人事处、国资处等职能部门审批、主管校长签字后予以支出。
财务管理情况:
1、建立健全的财务制度和资产管理办法。一是按照国家有关财经制度制定了一系列财务管理制度，如《黄冈师范学院财务管理制度》、《黄冈师范学院预算及经费支出管理制度》、《黄冈师范学院设备采购、维修、报废核算办法》、《黄冈师范学院维修及工程支出管理办法》，确保建设项目专款专用，确保重点建设项目配套经费以及根据建设需要追加经费足额到位；二是规范了资产和工程管理制度，规范了工作流程。
2、严格操作程序，确保制度有效执行。一是资产和工程管理方面，从立项、论证、计划、招标、采购、合同签订及验收都有严格的工作程序，都有财务处、审计处、纪委、国有资产管理处、后勤管理与基建处、教务处等部门派专人参加，实施全方位、全过程的跟踪、管理、监察；二是配合省财政的国库集中支付方式，保证财政专项资金专款专用。